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协和医院风湿病学科成立于2000年，是福建省第一个风湿免疫病学专科，是综合医疗、教学和科研于一体的风湿病学专业的权威医学研究机构。
目前，医疗服务团队包括主任医师（教授）1人，副主任医师（副教授）3人，主治医师及住院医师5人，平均年龄35岁；专业护理团队及实验室人员二十余人。在研博士、硕士研究生及研修人员5人。
科室设有病房、专家及主治医师门诊和省内一流的的风湿病分子实验室；每年接收多批来自全省各地的临床及实验室进修生、观摩及协作研究人员。学科自建科以来发展迅速，临床诊疗水平不断提高，不断扩大规模，病床数从原来的16张扩展至50张，接纳来自全省甚至海内外的风湿病患者。
风湿病专科门诊数量和住院人数均居于全省领先水平，在早期诊断和专业治疗风湿性疾病方面享有卓著声誉。长期治疗各种关节炎和自身免疫性疾病，包括系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、骨关节炎、强直性脊柱炎、痛风、多发性肌炎、皮肌炎、干燥综合征、硬皮病、混合性结缔组织病、白塞氏病等。 针对难治性类风湿关节炎、系统性红斑狼疮及干燥综合征等疾病，在省内率先开展了新的免疫治疗方法，包括环磷酰胺小冲击治疗系统性红斑狼疮等，取得显著疗效；同时还进行了骨关节炎、类风湿关节炎、痛风以及疑难杂症如：不明病因的肌肉、关节肿瘤、皮肤粘膜溃疡、免疫功能异常、长期不明原因发热等疾病的临床治疗研究，取得了较好的成绩，在福州市五区八县及周边城市享有盛誉，影响力辐射全省。
福建省临床免疫研究所挂靠其下，开展了多项针对类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、干燥综合征及强直性脊柱炎等风湿病的新的实验诊断方法。包括用间接免疫萤光法检测抗核抗体。在我省率先使用免疫印迹技术检测ENA抗体，建立ELISA检测方法抗心磷脂抗体、抗环瓜氨酸肽抗体、抗内皮细胞抗体、抗中性粒细胞胞浆抗体，大大提高了我省风湿病的早期诊断水平。研究课题涉及临床免疫，自身免疫病，抗肿瘤免疫等方面，初步形成了风湿免疫病学的研究。
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